永平秋操结束后，各省军队陆续返回驻地，有喜有悲，各安心思。
三天后的紫禁城勤政殿会议上，搁置了八个多月的之前在御前会议上所留下的新军练兵大臣一事重新被提上日程。来自各派势力的官员们又在人选问题上展开了激烈的辩驳，不过光绪似乎没有任何借口抢夺直隶新军兵权，更无法对李鸿章发飙，最后还得妥协。
10月18日，光绪帝发布上谕，宣布任命王辰浩为大清帝国钦命新建陆军练兵大臣，为朝廷全权操练新军。当天，军机处并总理衙门转发光绪旨意，正式公文于第二天送交天津直隶新军衙门，责令王辰浩尽快将练兵计划送交军机处审议。
10月22日，王辰浩进京述职，到兵部更换了关防印信，又到军机处领了钦差大臣谕令，顺便把练兵条陈带过去审核。
王辰浩的具体练兵方略是以直隶新军为标准和基础，首先在直隶京畿地区编练五个整编师，耗时三年。待这五个整编师练成后，再在全国各省编练二十个整编师，耗时五年。其中直隶五个师新军拱卫京畿安全，其他二十个师镇守地方边防。全国新建陆军练成二十五个师一共需要八年时间。
王辰浩制定这个练兵方略考虑到了朝廷的经济能力和防务需求，清朝把全国划分为18个行省，5个将军辖区，2个办事大臣辖区，还有8个总督，总计25个省级行政区。直隶五个师拱卫安全足以，18个行省每省一个师，5个将军辖区都是满清****把持，因此不设新军，2个办事大臣辖区设2个师协助，这样安排即不费钱还满足安全需要。
二十五个整编师全部练成需耗资七千万两白银，练成后每年军费和战斗力维持费用需要两千万两，这笔开支对于财政吃紧的清政府来说很庞大，因此王辰浩定了八年练成的标准时间。
而先在直隶练成五个师，这是王辰浩手下幕僚团的主意，也是李鸿章的意思。王辰浩手里得有拿得住朝廷七寸的王牌，而直隶关乎京畿安全，先在直隶练兵可以确保北洋利益的安全。
军机处的几个王大臣和汉大臣们开始研讨，军机满大臣刚毅排外强烈，对于王辰浩在直隶新军练兵过程中采取完全西化的方法表示不满，但碍于李鸿章的面子不好斥责王辰浩，只是鸡蛋里挑骨头要求王辰浩把军队建制名称和军衔制度改回来，和现有绿营八旗兵管制接轨。汉大臣翁同龢和瞿鸿禨是一伙的，看不惯李鸿章一派把持直隶，支持刚毅的意见。
三位王大臣恭亲王奕䜣、礼亲王世铎和庆亲王奕劻的态度暧昧，汉大臣张之洞远在武昌也是态度不明，李鸿章虽然也是军机汉大臣，但他一个说不过三个，只好让王辰浩适当的改改。
王辰浩也不想在这个问题上跟他们闹的不愉快，作为妥协，王辰浩表示可以把建制名称更改，但编制不能改，那样影响战斗力。而军衔制度是跟军队编制关联的，不容更改。
李鸿章于是根据王辰浩的意思同刚毅沟通，刚毅虽然还有些不满，但李鸿章肯让步是给他面子，因此不在再这个问题上刁难王辰浩了。
王辰浩修改后的军队编制由原来的军、师、旅、团、营、连、排、班，改为军、镇、协、标、营、连、排、班，只是换了名字并为更改编制，以此来满足刚毅等保守派的排外心理。
不过，翁同龢跟瞿鸿禨并不会罢休，为了给王辰浩制造麻烦。他们要求王辰浩在两年内练成三十六镇新军。
王辰浩知道他们的目的。其一，两年内完成三十六镇新军时间紧迫，不容易完成；其二，三十六镇新军耗资庞大，户部在翁同龢手里可以掐着军饷不给；其三，北洋没有那么多新式军官，练出来的新军质量肯定大打折扣，到时候考核不及格，就可能置王辰浩办事不利之罪；其四，三十六镇新军大多数得在各省就地编练，北洋还好说，南洋方面的官员肯定刁难。
这一系列的问题积累下来，两年练成三十六镇新军实在太难，翁同龢他们显然不怀好意。
对付翁同龢他们不能跟他们讲道理，他们铜牙铁嘴只能碰钉子。李鸿章把目标放在三位王大臣身上，奕䜣比较开明，经过李鸿章和王辰浩的一番解释后表示理解；奕劻那里只要有钱就行，王辰浩挑了件价值几万两银子的玉器送给他当即摆平；庆亲王世铎跟翁同龢关系好，他支持翁同龢。
这样双方不相上下，经过好一番争辩，最后慈禧太后和光绪二人出面给来了个折中，命王辰浩三年内在直隶编练八镇新军，六年内帮助各省督抚编练剩下的二十八镇新军。但光绪以俄国和日本威胁京畿安全为由，坚决要求王辰浩两年完成八镇新军。慈禧也觉得有道理，并不反对。这样折中的结果便是：两年后朝廷将会举行一次新军大操检查直隶八镇。六年后全国新军大操，检验三十六镇常备军的战斗能力。
这个折中虽然还是有些苛刻，但李鸿章已经尽了最大力争取。在人员配给上，两年练八镇新军倒是没问题，北洋有的是人才。只是在资金上恐怕需要北洋自己掏腰包先垫上了，因为翁同龢肯定不会痛快的掏钱的。
李鸿章现在可是没有王辰浩有钱，因此他是一毛不拔，要王辰浩自己掏腰包。
好在王辰浩知道自己的家底，远远不止李鸿章知道的那些，因此先垫上银子没有问题，所以他最终同意了这个练兵计划。
经过一个月的拉锯战，军机处一群人终于达成了妥协，要王辰浩在两年内练成八镇新军先拱卫京畿安全。
对此，王辰浩只是苦笑了一下，暗讨当个练兵大臣真是不容易，难怪当初老袁练了一镇新军后就从富人变成穷人了。